Пакет: embassy-domsearch (1:0.1.660-4 и другие)

[ Источник: embassy-domsearch  ]

Extra EMBOSS commands to search for protein domains

The DOMSEARCH programs were developed by Jon Ison and colleagues at MRC HGMP for their protein domain research. They are included as an EMBASSY package as a work in progress.

Applications in this DOMSEARCH release are seqfraggle (removes fragment sequences from DHF files), seqnr (removes redundancy from DHF files), seqsearch (generates PSI-BLAST hits (DHF file) from a DAF file), seqsort (Remove ambiguous classified sequences from DHF files) and seqwords (Generates DHF files from keyword search of UniProt).

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c, interface::commandline, Роль: Программа, Область: Утилита, Цель: Анализ

Другие пакеты, относящиеся к embassy-domsearch

• dep: emboss-lib (<< 6.6.1~)

  EMBOSS Libraries

  dep: emboss-lib (>= 6.6.0+dfsg) [не m68k, sh4, x32]

  dep: emboss-lib (>= 6.6.0-1~) [m68k, sh4, x32]

• dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.28) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, m68k, sh4, x32]

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libx11-6

  библиотека X11 для клиентской стороны

• rec: emboss

  European molecular biology open software suite

• sug: embassy

  Пакет недоступен

Загрузка embassy-domsearch

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	1:0.1.660-4	58,8 Кб	833,0 Кб	[список файлов]
amd64	1:0.1.660-4	59,7 Кб	609,0 Кб	[список файлов]
arm64	1:0.1.660-4+b1	58,7 Кб	834,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	1:0.1.660-3	59,4 Кб	570,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	1:0.1.660-4	63,2 Кб	608,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	1:0.1.660-3	60,5 Кб	581,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1:0.1.660-4	58,9 Кб	836,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1:0.1.660-4	60,2 Кб	833,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1:0.1.660-4	60,2 Кб	833,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1:0.1.660-4	58,1 Кб	573,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	1:0.1.660-3	61,8 Кб	569,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1:0.1.660-4	59,0 Кб	5 640,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	1:0.1.660-3	60,3 Кб	585,0 Кб	[список файлов]