Пакет: pbalign (0.3.2-1)

[ Источник: pbalign  ]

map Pacific Biosciences reads to reference DNA sequences

pbalign aligns PacBio reads to reference sequences, filters aligned reads according to user-specific filtering criteria, and converts the output to either the SAM format or PacBio Compare HDF5 (e.g., .cmp.h5) format.

This package is part of the SMRTAnalysis suite.

Другие пакеты, относящиеся к pbalign

• dep: blasr (>= 5.3+0)

  mapping single-molecule sequencing reads

• dep: python

  интерактивный объектно-ориентированный язык высокого уровня (ветка 2.x)

• dep: python-pbalign (= 0.3.2-1)

  map Pacific Biosciences reads to reference DNA sequences (Python2)

• dep: python-pkg-resources

  обнаружение пакетов и доступ к ресурсам через pkg_resources

• rec: hdf5-tools

  Hierarchical Data Format 5 (HDF5) - Runtime tools

• rec: python-pbh5tools

  tools for manipulating Pacific Biosciences HDF5 files -- Python 2 library

• sug: bowtie2

  ultrafast memory-efficient short read aligner

• sug: gmap

  spliced and SNP-tolerant alignment for mRNA and short reads

• sug: pbalign-doc

  documentation for pbalign

Загрузка pbalign

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
all	9,3 Кб	44,0 Кб	[список файлов]