Пакет: mauve-aligner (2.4.0+4736-1)
Ссылки для mauve-aligner
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код mauve-aligner:
- [mauve-aligner_2.4.0+4736-1.dsc]
- [mauve-aligner_2.4.0+4736.orig.tar.xz]
- [mauve-aligner_2.4.0+4736-1.debian.tar.xz]
Сопровождающие:
- Debian Med Packaging Team (Страница КК, Почтовый архив)
- Andreas Tille (Страница КК)
- Afif Elghraoui (Страница КК)
Внешние ресурсы:
- Сайт [darlinglab.org]
Подобные пакеты:
multiple genome alignment
Mauve is a system for efficiently constructing multiple genome alignments in the presence of large-scale evolutionary events such as rearrangement and inversion. Multiple genome alignment provides a basis for research into comparative genomics and the study of evolutionary dynamics. Aligning whole genomes is a fundamentally different problem than aligning short sequences.
Mauve has been developed with the idea that a multiple genome aligner should require only modest computational resources. It employs algorithmic techniques that scale well in the amount of sequence being aligned. For example, a pair of Y. pestis genomes can be aligned in under a minute, while a group of 9 divergent Enterobacterial genomes can be aligned in a few hours.
Mauve computes and interactively visualizes genome sequence comparisons. Using FastA or GenBank sequence data, Mauve constructs multiple genome alignments that identify large-scale rearrangement, gene gain, gene loss, indels, and nucleotide substutition.
Mauve is developed at the University of Wisconsin.
Другие пакеты, относящиеся к mauve-aligner
|
|
|
|
-
- dep: icedtea-netx-common
- виртуальный пакет, предоставляемый icedtea-netx
-
- dep: java-wrappers
- обертки для исполняемых java
-
- dep: libbiojava-java
- Java API to biological data and applications (default version)
-
- dep: libbiojava1.7-java
- Java API to biological data and applications (version 1.7)
-
- dep: libcommons-cli-java
- Command line arguments and options parsing library
-
- dep: libdbus-java
- simple interprocess messaging system (Java implementation)
-
- dep: libunixsocket-java
- Unix socket API and bindings for Java
-
- dep: libzeus-jscl-java
- Zeus Java Swing Components Library
-
- dep: progressivemauve
- multiple genome alignment algorithms
Загрузка mauve-aligner
Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
---|---|---|---|
amd64 | 479,9 Кб | 546,0 Кб | [список файлов] |
arm64 | 479,9 Кб | 546,0 Кб | [список файлов] |
armhf | 479,9 Кб | 546,0 Кб | [список файлов] |
i386 | 479,9 Кб | 546,0 Кб | [список файлов] |