[ Источник: optimir ]
Пакет: optimir (1.0-3)
Ссылки для optimir
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код optimir:
Сопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
Integrating genetic variations in miRNA alignment
OptimiR is a miRSeq data alignment workflow. It integrates genetic information to assess the impact of variants on miRNA expression.
OptimiR: A bioinformatics pipeline designed to detect and quantify miRNAs, isomiRs and polymiRs from miRSeq data, & study the impact of genetic variations on polymiRs' expression.
Другие пакеты, относящиеся к optimir
|
|
|
|
-
- dep: bowtie2
- ultrafast memory-efficient short read aligner
-
- dep: cutadapt
- Clean biological sequences from high-throughput sequencing reads
-
- dep: python3
- интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)
-
- dep: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
-
- dep: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
-
- dep: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- rec: r-cran-ggplot2
- implementation of the Grammar of Graphics
-
- rec: r-cran-gridextra
- GNU R package with extensions for the grid package
Загрузка optimir
| Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|
| all | 1 004,0 Кб | 7 404,0 Кб | [список файлов] |