[ Источник: simka ]
Пакет: simkamin (1.5.3-4)
Ссылки для simkamin
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код simka:
Сопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
approximate comparative metagenomics method dedicated to NGS datasets
Simka is a de novo comparative metagenomics tool. Simka represents each dataset as a k-mer spectrum and compute several classical ecological distances between them.
The difference with Simka stands in the fact that SimkaMin outputs approximate (but very similar) results by subsampling the kmer space. With this strategy, and with default parameters, SimkaMin is an order of magnitude faster, uses 10 times less memory and 70 times less disk than Simka.
Другие пакеты, относящиеся к simkamin
|
|
|
|
-
- dep: python3
- интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)
Загрузка simkamin
| Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|
| all | 31,3 Кб | 385,0 Кб | [список файлов] |