Пакет: khmer (3.0.0~a3+dfsg-4 и другие)

[ Источник: khmer  ]

in-memory DNA sequence kmer counting, filtering & graph traversal

khmer is a library and suite of command line tools for working with DNA sequence. It is primarily aimed at short-read sequencing data such as that produced by the Illumina platform. khmer takes a k-mer-centric approach to sequence analysis, hence the name.

Теги: Биология: Fasta/Pearson, Нуклеиновые кислоты, Область: field::biology, field::biology:bioinformatics, Реализовано на: implemented-in::c++, implemented-in::python, Пользовательский интерфейс: Командная строка, Роль: role::program, use::analysing, Цель: Сравнение, Фильтрация

Другие пакеты, относящиеся к khmer

• dep: khmer-common

  common files for the khmer project tools

• dep: libbz2-1.0

  библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)

• dep: libc6 (>= 2.32)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.12)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: python3-screed

  short nucleotide read sequence utils in Python 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)

  библиотека сжатия

Загрузка khmer

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	3.0.0~a3+dfsg-4+b2	6 913,1 Кб	37 398,0 Кб	[список файлов]