Пакет: disulfinder (1.2.11-12)

[ Источник: disulfinder  ]

cysteines disulfide bonding state and connectivity predictor

'disulfinder' is for predicting the disulfide bonding state of cysteines and their disulfide connectivity starting from sequence alone. Disulfide bridges play a major role in the stabilization of the folding process for several proteins. Prediction of disulfide bridges from sequence alone is therefore useful for the study of structural and functional properties of specific proteins. In addition, knowledge about the disulfide bonding state of cysteines may help the experimental structure determination process and may be useful in other genomic annotation tasks.

'disulfinder' predicts disulfide patterns in two computational stages: (1) the disulfide bonding state of each cysteine is predicted by a BRNN-SVM binary classifier; (2) cysteines that are known to participate in the formation of bridges are paired by a Recursive Neural Network to obtain a connectivity pattern.

Теги: Роль: Программа

Другие пакеты, относящиеся к disulfinder

• dep: disulfinder-data

  data files for predictor of disulfide bonds in proteins

• dep: libc6 (>= 2.33)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

Загрузка disulfinder

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	233,3 Кб	676,0 Кб	[список файлов]
arm64	200,7 Кб	588,0 Кб	[список файлов]
armel	185,2 Кб	567,0 Кб	[список файлов]
armhf	190,6 Кб	411,0 Кб	[список файлов]
i386	242,0 Кб	707,0 Кб	[список файлов]
mips64el	203,5 Кб	744,0 Кб	[список файлов]
mipsel	203,8 Кб	725,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	236,6 Кб	764,0 Кб	[список файлов]
s390x	203,5 Кб	676,0 Кб	[список файлов]