パッケージ: disulfinder (1.2.11-12)

[ ソース: disulfinder  ]

cysteines disulfide bonding state and connectivity predictor

'disulfinder' is for predicting the disulfide bonding state of cysteines and their disulfide connectivity starting from sequence alone. Disulfide bridges play a major role in the stabilization of the folding process for several proteins. Prediction of disulfide bridges from sequence alone is therefore useful for the study of structural and functional properties of specific proteins. In addition, knowledge about the disulfide bonding state of cysteines may help the experimental structure determination process and may be useful in other genomic annotation tasks.

'disulfinder' predicts disulfide patterns in two computational stages: (1) the disulfide bonding state of each cysteine is predicted by a BRNN-SVM binary classifier; (2) cysteines that are known to participate in the formation of bridges are paired by a Recursive Neural Network to obtain a connectivity pattern.

タグ: 役割: プログラム

その他の disulfinder 関連パッケージ

• dep: disulfinder-data

  data files for predictor of disulfide bonds in proteins

• dep: libc6 (>= 2.33)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

disulfinder のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	233.3 kB	676.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	200.7 kB	588.0 kB	[ファイル一覧]
armel	185.2 kB	567.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	190.6 kB	411.0 kB	[ファイル一覧]
i386	242.0 kB	707.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	203.5 kB	744.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	203.8 kB	725.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	236.6 kB	764.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	203.5 kB	676.0 kB	[ファイル一覧]