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Package: boxshade (3.3.1-14) [debports]

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Impressão bonita de múltiplos alinhamentos de sequências

Boxshade é um programa para criar impressões bonitas a partir de multi alinhamentos de proteínas de sequências DNA. O programa não executa o próprio alinhamento e necessita de ler um ficheiro que foi criado por um programa de alinhamentos múltiplos ou editado manualmente com as respectivas ferramentas.

Boxshade lê múltiplos alinhamentos de sequências de ficheiros PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED-data e ESEE-save (limitado a um máximo de 150 sequências com até 10000 elementos cada). Vários tipos de shading pode ser aplicados a resíduos idênticos/semelhantes. Os resultados são postos no écran ou num ficheiro com os seguintes formatos: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-printer, ASCII, xFIG, PICT, HTML

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