Package: boxshade (3.3.1-14) [debports]

[ Source:  ]

Impressão bonita de múltiplos alinhamentos de sequências

Boxshade é um programa para criar impressões bonitas a partir de multi alinhamentos de proteínas de sequências DNA. O programa não executa o próprio alinhamento e necessita de ler um ficheiro que foi criado por um programa de alinhamentos múltiplos ou editado manualmente com as respectivas ferramentas.

Boxshade lê múltiplos alinhamentos de sequências de ficheiros PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED-data e ESEE-save (limitado a um máximo de 150 sequências com até 10000 elementos cada). Vários tipos de shading pode ser aplicados a resíduos idênticos/semelhantes. Os resultados são postos no écran ou num ficheiro com os seguintes formatos: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-printer, ASCII, xFIG, PICT, HTML

Other Packages Related to boxshade

• dep: libc6 (>= 2.16)

  Biblioteca GNU C: Bibliotecas partilhadas
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• sug: kalign

  Alinhamento de sequência múltipla global e progressivo

  or clustalw

  global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

  or mafft

  Programa de múltiplos alinhamentos para amino ácidos ou sequências nucleotídeas

  or hmmer

  Modelos Markov de perfil escondido para análises de sequências de proteínas

• sug: seaview

  Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

• sug: texlive-latex-extra

  TeX Live: LaTeX additional packages

• sug: xfig

  Facility for Interactive Generation of figures under X11

Download boxshade

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
x32 (unofficial port)	54.4 kB	160.0 kB	[list of files]