Package: kalign (1:3.3-1 and others)

[ Source: kalign  ]

Alinhamento de sequência múltipla global e progressivo

Kalign é uma ferramenta da linha de comandos para realizar alinhamentos múltiplos de sequências biológicas. Usa o algoritmo de correspondência de sequências de Muth-Manber, para melhorar tanto a precisão como a velocidade do alinhamento. Usa uma abordagem de alinhamento progressiva e global, enriquecida por usar um algoritmo para sequências de correspondências aproximadas, para calcular distâncias de sequências e por integrar correspondências locais no outro nível de alinhamento global.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to kalign

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteca GNU C: Bibliotecas partilhadas
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• enh: bioperl-run

  BioPerl wrappers: scripts

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Download kalign

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
ppc64el	1:3.3-1+b3	85.0 kB	341.0 kB	[list of files]