Package: autodock (4.2.6-9)

[ Source: autodocksuite  ]

análise de ligação do ligante (ligand) a estrutura de proteína

AutoDock é o principal representante dos programas que endereçam a simulação do acoplamento de ligantes químicos bastante pequenos para receptores de proteínas bastantes grandes. As versões anteriores tinham toda a flexibilidade nos ligantes enquanto que a proteína foi mantida em modo rígido. Esta última versão 4 também permite uma flexibilidade de cadeias laterais seleccionadas dos resíduos de superfície, ou seja, leva os 'rotamers' em conta.

O programa AutoDock realiza o acoplamento do ligante a um conjunto de grelhas descrevendo a proteína alvo. O AutoGrid pré-calcula estas grelhas.

Tags: Field: Biology, Structural Biology, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, works-with-format::TODO, Works with: 3D Model, Need an extra tag

Other Packages Related to autodock

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteca GNU C: Bibliotecas partilhadas
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1)

  Biblioteca de suporte do GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Biblioteca C++ padrão GNU v3

• sug: autogrid

  Pré-calcula as ligações de ligantes aos seus receptores

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