Package: tree-ppuzzle (5.3~rc16+dfsg-9)

[ Source: tree-puzzle  ]

Reconstrução paralelizada de árvores filogenéticas por máxima parecença

TREE-PUZZLE (o novo nome para PUZZLE) é um programa de consola interactivo que implementa um algoritmo rápido de pesquisa de árvore, intrigante em quarteto, que permite a análise de grandes conjuntos de dados e atribui automaticamente estimativas de suporte para cada ramo interno. TREE-PUZZLE também computa distâncias pareadas de máxima parecença assim como o alcance de ramificações para árvores especificadas pelo utilizador. O alcance das ramificações também pode ser calculado sub a assumpção de relógio. Adicionalmente, TREE-PUZZLE oferece um método inovador de mapeamento de parecenças, para investigar o suporte de um ramo interno hipotético sem computar uma árvore inteira e para visualizar o conteúdo filogenético de uma sequência de alinhamento.

Esta é uma versão paralela do tree-puzzle.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, use::comparing, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to tree-ppuzzle

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteca GNU C: Bibliotecas partilhadas
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libopenmpi3 (>= 4.1.2)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsprng2

  SPRNG Scalable Parallel RNG library -- library package

• dep: openmpi-bin

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• rec: tree-puzzle-doc

  Reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood (doc)

• sug: phylip

  package of programs for inferring phylogenies

• sug: treetool

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