[ Fonte: srst2 ]
Pacote: srst2 (0.2.0-13)
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Recursos de Debian:
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Mantenedores(as):
- Debian Med Packaging Team (QA Página, E-mail Arquivo)
- Andreas Tille (QA Página)
- Étienne Mollier (QA Página)
Fontes externas:
- Pagina principal [katholt.github.io]
Pacotes similares:
Short Read Sequence Typing for Bacterial Pathogens
This program is designed to take Illumina sequence data, a MLST database and/or a database of gene sequences (e.g. resistance genes, virulence genes, etc) and report the presence of STs and/or reference genes.
Outros pacotes relacionados a srst2
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- dep: bowtie2
- ultrafast memory-efficient short read aligner
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- dep: cd-hit
- suite of programs designed to quickly group sequences
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- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
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- dep: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
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- dep: python3-scipy
- ferramentas científicas para Python 3
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- dep: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
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- rec: python3-rpy2
- Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)
Download de srst2
| Arquitetura | Tamanho do pacote | Tamanho instalado | Arquivos |
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| amd64 | 59.9 kB | 265.0 kB | [lista de arquivos] |
| arm64 | 59.9 kB | 265.0 kB | [lista de arquivos] |
| mips64el | 59.9 kB | 265.0 kB | [lista de arquivos] |
| ppc64el | 59.9 kB | 265.0 kB | [lista de arquivos] |
| riscv64 | 59.9 kB | 265.0 kB | [lista de arquivos] |