[ Source: ampliconnoise ]
Package: ampliconnoise (1.29-15 and others)
Links for ampliconnoise
Debian Resources:
Download Source Package ampliconnoise:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Andreas Tille (QA Page)
- Pranav Ballaney (QA Page)
- Étienne Mollier (QA Page)
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
remoção de ruído de amplicons PCR sequenciados em 454
AmpliconNoise é um pacote de aplicações para arrumar sequências de dados de alto rendimento. Consiste em três principais partes:
Pyronoise - realiza clustering baseado em fluxograma para encontrar leituras incorretas SeqNoise - remove mutações de pontos PCR Perseus - remove quimeras PCR sem a necessidade de um conjunto de sequências de referência
Anteriormente, havia um "Pyronoise" independente dos(as) mesmos(as) autores(as) e este pacote inclui uma versão atualizada. Também existe um "Denoiser" no Qiime, que é relacionado, mas distinto.
Other Packages Related to ampliconnoise
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg)
- GNU Scientific Library (GSL) -- library package
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- dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6)
- high performance message passing library -- shared library
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- dep: mafft
- Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences
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- rec: mpi-default-bin
- Standard MPI runtime programs (metapackage)
Download ampliconnoise
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| mips64el | 1.29-15+b1 | 1,072.8 kB | 2,422.0 kB | [list of files] |