Pacote: sumaclust (1.0.36+ds-4 e outros)

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Fontes externas:

Pagina principal [metabarcoding.org]

Pacotes similares:

fast and exact clustering of genomic sequences

With the development of next-generation sequencing, efficient tools are needed to handle millions of sequences in reasonable amounts of time. Sumaclust is a program developed by the LECA. Sumaclust aims to cluster sequences in a way that is fast and exact at the same time. This tool has been developed to be adapted to the type of data generated by DNA metabarcoding, i.e. entirely sequenced, short markers. Sumaclust clusters sequences using the same clustering algorithm as UCLUST and CD- HIT. This algorithm is mainly useful to detect the 'erroneous' sequences created during amplification and sequencing protocols, deriving from 'true' sequences.

Outros pacotes relacionados a sumaclust

depende

recomenda

sugere

melhora

dep: libc6 (>= 2.34) [não alpha, ia64, loong64, sh4]

GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.33) [ia64]

GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
dep: libgomp1 (>= 6)

biblioteca de suporte ao GCC OpenMP (GOMP)
dep: libsuma1 (>= 1.0.35)

shared library for sumatra and sumaclust

Download de sumaclust

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis
Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	1.0.36+ds-4	101.4 kB	196.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	1.0.36+ds-4	101.0 kB	164.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	1.0.36+ds-4	100.5 kB	196.0 kB	[lista de arquivos]
armel	1.0.36+ds-4	102.6 kB	195.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	1.0.36+ds-4	100.4 kB	195.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	1.0.36+ds-4	102.5 kB	164.0 kB	[lista de arquivos]
i386	1.0.36+ds-4	101.6 kB	163.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	1.0.36+ds-2	104.5 kB	181.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	1.0.36+ds-4	100.8 kB	195.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	1.0.36+ds-4	99.4 kB	163.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	1.0.36+ds-4	101.2 kB	197.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	1.0.36+ds-4	102.1 kB	196.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	1.0.36+ds-4	102.0 kB	196.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	1.0.36+ds-4	100.7 kB	156.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	1.0.36+ds-4	101.4 kB	163.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	1.0.36+ds-4	102.5 kB	195.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	1.0.36+ds-4	100.1 kB	1,157.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	1.0.36+ds-4	100.9 kB	159.0 kB	[lista de arquivos]