Pacote: sigma-align (1.1.3-9 e outros)

[ Fonte: sigma-align  ]

Simple greedy multiple alignment of non-coding DNA sequences

Sigma (“Simple greedy multiple alignment”) is an alignment program. It's algorithm and scoring scheme are designed specifically for non-coding DNA sequence.

It uses a strategy of seeking the best possible gapless local alignments. This happens at each step making the best possible alignment consistent with existing alignments. It scores the significance of the alignment based on the lengths of the aligned fragments and a background model. These may be supplied or estimated from an auxiliary file of intergenic DNA.

Etiquetas: Campo: Biologia, Bioinformática, Implementado em: implemented-in::c, interface::commandline, Função: Programa, Alcance: Utilitários, Propósito: use::analysing, use::comparing, Suporta o formato: Texto puro, Funciona com: Precisa de uma etiqueta extra

Outros pacotes relacionados a sigma-align

• dep: libc6 (>= 2.34) [não alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.12.0)

  biblioteca GLib de rotinas C

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Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	1.1.3-9	23.0 kB	89.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	1.1.3-9	23.0 kB	61.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	1.1.3-9+b1	22.4 kB	90.0 kB	[lista de arquivos]
armel	1.1.3-9	22.1 kB	56.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	1.1.3-9	20.2 kB	48.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	1.1.3-9	22.6 kB	57.0 kB	[lista de arquivos]
i386	1.1.3-9	23.7 kB	60.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	1.1.3-9	28.3 kB	86.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	1.1.3-9	22.3 kB	73.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	1.1.3-9	20.1 kB	56.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	1.1.3-9	23.0 kB	91.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	1.1.3-9	25.8 kB	89.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	1.1.3-9	26.2 kB	89.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	1.1.3-9	23.3 kB	53.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	1.1.3-9	24.0 kB	65.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	1.1.3-9	23.8 kB	88.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	1.1.3-9	21.2 kB	1,050.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	1.1.3-9	22.9 kB	56.0 kB	[lista de arquivos]