Pacote: plink (1.07+dfsg-4 e outros)

[ Fonte: plink  ]

whole-genome association analysis toolset

plink expects as input the data from SNP (single nucleotide polymorphism) chips of many individuals and their phenotypical description of a disease. It finds associations of single or pairs of DNA variations with a phenotype and can retrieve SNP annotation from an online source.

SNPs can evaluated individually or as pairs for their association with the disease phenotypes. The joint investigation of copy number variations is supported. A variety of statistical tests have been implemented.

Please note: The executable was renamed to plink1 because of a name clash. Please read more about this in /usr/share/doc/plink/README.Debian.

Etiquetas: Campo: Biologia, Bioinformática, Implementado em: implemented-in::c++, interface::commandline, Função: Programa, Propósito: Análise

Outros pacotes relacionados a plink

• dep: libc6 (>= 2.29) [hppa, m68k, ppc64, sparc64, x32]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.32) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [amd64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x]

  dep: libc6 (>= 2.36) [loong64]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.32) [ia64]

• dep: libcrypt1 (>= 1:4.1.0)

  biblioteca compartilhada libcrypt

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, s390x, x32]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11) [não alpha, arm64, riscv64]

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 11.2.0-10) [alpha]

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  biblioteca para determinar a cadeia de chamadas de um programa - execução

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

• rec: med-config (>= 2.1)

  Debian Med general config package

Download de plink

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	1.07+dfsg-4	1,194.2 kB	4,559.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	1.07+dfsg-4+b1	1,210.2 kB	3,814.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	1.07+dfsg-4+b2	1,080.9 kB	3,380.0 kB	[lista de arquivos]
armel	1.07+dfsg-4+b1	1,032.1 kB	3,381.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	1.07+dfsg-4+b1	1,055.0 kB	2,357.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	1.07+dfsg-4	1,104.6 kB	3,448.0 kB	[lista de arquivos]
i386	1.07+dfsg-4+b1	1,266.7 kB	4,141.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	1.07+dfsg-4	1,529.8 kB	8,466.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	1.07+dfsg-4	1,097.9 kB	3,531.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	1.07+dfsg-4	1,124.2 kB	3,700.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	1.07+dfsg-4+b1	1,030.9 kB	4,182.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	1.07+dfsg-4	1,108.7 kB	4,021.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	1.07+dfsg-4+b1	1,165.2 kB	4,086.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	1.07+dfsg-4+b1	1,178.4 kB	2,804.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	1.07+dfsg-4+b1	1,087.2 kB	3,933.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	1.07+dfsg-4	1,518.0 kB	3,416.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	1.07+dfsg-4	984.6 kB	3,473.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	1.07+dfsg-4	1,180.5 kB	3,508.0 kB	[lista de arquivos]