パッケージ: plink (1.07+dfsg-4 など)

[ ソース: plink  ]

whole-genome association analysis toolset

plink expects as input the data from SNP (single nucleotide polymorphism) chips of many individuals and their phenotypical description of a disease. It finds associations of single or pairs of DNA variations with a phenotype and can retrieve SNP annotation from an online source.

SNPs can evaluated individually or as pairs for their association with the disease phenotypes. The joint investigation of copy number variations is supported. A variety of statistical tests have been implemented.

Please note: The executable was renamed to plink1 because of a name clash. Please read more about this in /usr/share/doc/plink/README.Debian.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c++, interface::commandline, 役割: プログラム, 目的: 解析

その他の plink 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.29) [hppa, m68k, ppc64, sparc64, x32]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.32) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [amd64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.32) [ia64]

• dep: libcrypt1 (>= 1:4.1.0)

  libcrypt shared library

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, s390x, x32]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libstdc++6 (>= 11) [alpha, arm64, riscv64 以外]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 11.2.0-10) [alpha]

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  圧縮ライブラリ - ランタイム

• rec: med-config (>= 2.1)

  Debian Med general config package

plink のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	1.07+dfsg-4	1,194.2 kB	4,559.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.07+dfsg-4+b1	1,210.2 kB	3,814.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.07+dfsg-4+b2	1,080.9 kB	3,380.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.07+dfsg-4+b1	1,032.1 kB	3,381.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.07+dfsg-4+b1	1,055.0 kB	2,357.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	1.07+dfsg-4	1,104.6 kB	3,448.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.07+dfsg-4+b1	1,266.7 kB	4,141.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	1.07+dfsg-4	1,529.8 kB	8,466.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	1.07+dfsg-4	1,124.2 kB	3,700.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.07+dfsg-4+b1	1,030.9 kB	4,182.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.07+dfsg-4	1,108.7 kB	4,021.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.07+dfsg-4+b1	1,165.2 kB	4,086.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.07+dfsg-4+b1	1,178.4 kB	2,804.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.07+dfsg-4+b1	1,087.2 kB	3,933.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	1.07+dfsg-4	1,518.0 kB	3,416.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.07+dfsg-4	984.6 kB	3,473.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	1.07+dfsg-4	1,180.5 kB	3,508.0 kB	[ファイル一覧]