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Package: avogadro (1.99.0-1 and others) [debports]

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sistema de modelagem e gráficos moleculares

Avogadro é um sistema de modelagem e gráficos moleculares para moléculas e biomoléculas. Pode visualizar propriedades como orbitais moleculares ou potenciais eletrostáticos e tem um construtor molecular intuitivo.

Inclui os seguintes recursos:

 * Modelador molecular com otimização automática de geometria baseada em
campo de força;
 * Mecânica molecular incluindo restrições e buscas de confórmeros;
 * Visualização de orbitais moleculares e isosuperfícies gerais;
 * Visualização de vibrações e plotagem de espectro vibracional;
 * Suporte para células unitárias cristalográficas;
 * Geração de entrada para os pacotes de química quântica Gaussian, GAMESS
e MOLPRO;
 * Arquitetura de extensões flexível e scripts em Python.

Os formatos de arquivos que o Avogadro pode ler incluem PDB, XYZ, CML, CIF, Molden, assim como a saída dos pacotes Gaussian, GAMESS e MOLPRO.

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