[ Source: ampliconnoise ]
Package: ampliconnoise (1.29-9)
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Debian Resources:
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Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Tim Booth (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Pranav Ballaney (QA Page)
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
remoção de ruído de amplicons PCR sequenciados em 454
AmpliconNoise é um pacote de aplicações para arrumar sequências de dados de alto rendimento. Consiste em três principais partes:
Pyronoise - realiza clustering baseado em fluxograma para encontrar leituras incorretas SeqNoise - remove mutações de pontos PCR Perseus - remove quimeras PCR sem a necessidade de um conjunto de sequências de referência
Anteriormente, havia um "Pyronoise" independente dos(as) mesmos(as) autores(as) e este pacote inclui uma versão atualizada. Também existe um "Denoiser" no Qiime, que é relacionado, mas distinto.
Other Packages Related to ampliconnoise
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libgsl25 (>= 2.6)
- GNU Scientific Library (GSL) -- library package
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- dep: libopenmpi3 (>= 4.0.4)
- high performance message passing library -- shared library
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- dep: mafft
- Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences
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- rec: openmpi-bin
- biblioteca de passagem de mensagens de alto desempenho -- binários
Download ampliconnoise
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| armel | 1,065.4 kB | 1,955.0 kB | [list of files] |