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Pacote: seqtk (1.3-4)

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Fast and lightweight tool for processing sequences in the FASTA or FASTQ format

Currently, seqtk supports quality based trimming with the phred algorithm, converting fastq to fasta, reverse complementing sequences, extracting or masking subsequences in regions given in a BED/name list file, and more. It contains a subsampling module to sample exactly n sequences or a fraction of sequences.

Seqtk supports both fasta and fastq input files, which can be optionally gzip compressed.

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i386 32.8 kB91.0 kB [lista de arquivos]
mips64el 28.4 kB89.0 kB [lista de arquivos]
mipsel 28.9 kB88.0 kB [lista de arquivos]
ppc64el 32.5 kB151.0 kB [lista de arquivos]
s390x 27.5 kB83.0 kB [lista de arquivos]