Paquet : seqtk (1.3-4)

[ Paquet source : seqtk  ]

Fast and lightweight tool for processing sequences in the FASTA or FASTQ format

Currently, seqtk supports quality based trimming with the phred algorithm, converting fastq to fasta, reverse complementing sequences, extracting or masking subsequences in regions given in a BED/name list file, and more. It contains a subsampling module to sample exactly n sequences or a fraction of sequences.

Seqtk supports both fasta and fastq input files, which can be optionally gzip compressed.

Autres paquets associés à seqtk

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger seqtk

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	29,9 ko	83,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	27,6 ko	87,0 ko	[liste des fichiers]
armel	28,5 ko	87,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	28,1 ko	87,0 ko	[liste des fichiers]
i386	32,8 ko	91,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	28,4 ko	89,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	28,9 ko	88,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	32,5 ko	151,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	27,5 ko	83,0 ko	[liste des fichiers]