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Package: tabix (1.16+ds-3)

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indexador genérico para arquivos de posicionamento de genoma delimitados por TAB

Tabix indexa arquivos nos quais algumas colunas indicam coordenadas de sequência: nome (em geral um cromossomo), começo e fim. Os dados de entrada devem ser ordenados pela posição e comprimidos com bgzip (fornecido neste pacote), que tem uma interface semelhante ao gzip. Depois da indexação, tabix pode recuperar rapidamente linhas de dados por coordenadas de cromossomos. A recuperação rápida de dados também se dá por rede se uma URI for dada como nome de arquivo.

Este pacote foi construído com a fonte HTSlib, e fornece as ferramentas bgzip, htsfile e tabix.

Tags: Implemented in: C, Role: Program, Science: science::calculation, use::calculating, Supports Format: HTML, Hypertext Markup Language, Works with: Text

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