Pakiet: phybin (0.3-6 i inne)

[ Pakiet źródłowy: phybin  ]

binning/clustering newick trees by topology

PhyBin is a simple command line tool that classifies a set of Newick tree files by their topology. The purpose of it is to take a large set of tree files and browse through the most common tree topologies.

It can do simple binning of identical trees or more complex clustering based on an all-to-all Robinson-Foulds distance matrix.

phybin produces output files that characterize the size and contents of each bin or cluster (including generating GraphViz-based visual representations of the tree topologies).

Inne pakiety związane z phybin

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [armel]

  Biblioteka wsparcia zapewniająca wbudowane funkcje __atomic

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libffi8 (>= 3.4)

  Pliki biblioteki uruchomieniowej dla interfejsu funkcji obcych

• dep: libgmp10 (>= 2:6.2.1+dfsg1) [nie riscv64]

  Biblioteka działań arytmetycznych z dużą dokładnością

  dep: libgmp10 (>= 2:6.3.0+dfsg) [riscv64]

Pobieranie phybin

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	0.3-6	1 614,5 KiB	11 976,0 KiB	[lista plików]
arm64	0.3-6	4 125,4 KiB	30 322,0 KiB	[lista plików]
armel	0.3-6	4 407,2 KiB	28 552,0 KiB	[lista plików]
armhf	0.3-6	4 444,7 KiB	28 524,0 KiB	[lista plików]
i386	0.3-6	4 957,4 KiB	37 630,0 KiB	[lista plików]
mips64el	0.3-6	5 284,0 KiB	58 772,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	0.3-6	3 498,6 KiB	38 137,0 KiB	[lista plików]
riscv64	0.3-6+b1	4 531,3 KiB	31 537,0 KiB	[lista plików]
s390x	0.3-6	7 543,2 KiB	53 627,0 KiB	[lista plików]