Pakiet: python3-pyabpoa (1.5.1-1)

[ Pakiet źródłowy: abpoa  ]

adaptive banded Partial Order Alignment - python3 module

abPOA is an extended version of Partial Order Alignment (POA) that performs adaptive banded dynamic programming (DP) with an SIMD implementation. abPOA can perform multiple sequence alignment (MSA) on a set of input sequences and generate a consensus sequence by applying the heaviest bundling algorithm to the final alignment graph.

abPOA can generate high-quality consensus sequences from error-prone long reads and offer significant speed improvement over existing tools.

abPOA supports three alignment modes (global, local, extension) and flexible scoring schemes that allow linear, affine and convex gap penalties. It right now supports SSE2/SSE4.1/AVX2 vectorization.

This package provides the python3 module of abPOA.

Inne pakiety związane z python3-pyabpoa

• dep: libc6 (>= 2.33)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: python3 (<< 3.13)

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie python3-pyabpoa

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	194,5 KiB	779,0 KiB	[lista plików]
arm64	165,3 KiB	675,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	194,9 KiB	931,0 KiB	[lista plików]