Paquet : python3-pyabpoa (1.5.3-1)

[ Paquet source : abpoa  ]

adaptive banded Partial Order Alignment - python3 module

abPOA is an extended version of Partial Order Alignment (POA) that performs adaptive banded dynamic programming (DP) with an SIMD implementation. abPOA can perform multiple sequence alignment (MSA) on a set of input sequences and generate a consensus sequence by applying the heaviest bundling algorithm to the final alignment graph.

abPOA can generate high-quality consensus sequences from error-prone long reads and offer significant speed improvement over existing tools.

abPOA supports three alignment modes (global, local, extension) and flexible scoring schemes that allow linear, affine and convex gap penalties. It right now supports SSE2/SSE4.1/AVX2 vectorization.

This package provides the python3 module of abPOA.

Autres paquets associés à python3-pyabpoa

• dep: libc6 (>= 2.33)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: python3 (<< 3.13)

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

  dep: python3 (>= 3.12~)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger python3-pyabpoa

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	160,0 ko	420,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	138,6 ko	412,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	163,7 ko	476,0 ko	[liste des fichiers]