wszystkie opcje
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: bowtie2  ]

Pakiet: bowtie2 (2.5.4-1)

Odnośniki dla bowtie2

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego bowtie2:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

ultrafast memory-efficient short read aligner

is an ultrafast and memory-efficient tool for aligning sequencing reads to long reference sequences. It is particularly good at aligning reads of about 50 up to 100s or 1,000s of characters, and particularly good at aligning to relatively long (e.g. mammalian) genomes.

Bowtie 2 indexes the genome with an FM Index to keep its memory footprint small: for the human genome, its memory footprint is typically around 3.2 GB. Bowtie 2 supports gapped, local, and paired-end alignment modes

Znaczniki: Biologia: Kwasy nukleinowe, Dziedzina: Biologia, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, Interfejs użytkownika: Wiersz poleceń, Rola: role::program, use::comparing, Działa z: Sekwencje biologiczne

Inne pakiety związane z bowtie2

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie bowtie2

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
mips64el 1 416,5 KiB6 185,0 KiB [lista plików]