Pakiet: lighter (1.1.2-7)

[ Pakiet źródłowy: lighter  ]

fast and memory-efficient sequencing error corrector

Lighter is a fast, memory-efficient tool for correcting sequencing errors. Lighter avoids counting k-mers. Instead, it uses a pair of Bloom filters, one holding a sample of the input k-mers and the other holding k-mers likely to be correct. As long as the sampling fraction is adjusted in inverse proportion to the depth of sequencing, Bloom filter size can be held constant while maintaining near-constant accuracy. Lighter is parallelized, uses no secondary storage, and is both faster and more memory-efficient than competing approaches while achieving comparable accuracy.

Inne pakiety związane z lighter

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, i386]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie lighter

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	46,2 KiB	124,0 KiB	[lista plików]
arm64	44,1 KiB	116,0 KiB	[lista plików]
armel	44,0 KiB	179,0 KiB	[lista plików]
armhf	44,1 KiB	115,0 KiB	[lista plików]
i386	51,1 KiB	135,0 KiB	[lista plików]
mips64el	48,8 KiB	182,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	49,7 KiB	180,0 KiB	[lista plików]
s390x	45,8 KiB	128,0 KiB	[lista plików]