wszystkie opcje
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: yanosim  ]

Pakiet: yanosim (0.1-5)

Odnośniki dla yanosim

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego yanosim:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

read simulator nanopore DRS datasets

Yanosim has three options:

1. yanosim model:

   Creates an model of mismatches, insertions and deletions
   based on an alignment of nanopore DRS reads to a
   reference. Reads should be aligned to a transcriptome
   i.e. without spliced alignment, using minimap2. They
   should have the cs tag.
2. yanosim quantify:
   Quantify the number of reads mapping to each
   transcript in a reference, so that the right number
   of reads can be simulated.
3. yanosim simulate:
   Given a model created using yanosim model, and
   per-transcript read counts created using yanosim
   simulate, simulate error-prone long-reads from the
   given fasta file.

Inne pakiety związane z yanosim

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie yanosim

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
i386 9,4 KiB45,0 KiB [lista plików]