Pakiet: r-bioc-dnacopy (1.76.0-1)

[ Pakiet źródłowy: r-bioc-dnacopy  ]

R package: DNA copy number data analysis

Implements the circular binary segmentation (CBS) algorithm to segment DNA copy number data and identify genomic regions with abnormal copy number.

This package is for analyzing array DNA copy number data, which is usually (but not always) called array Comparative Genomic Hybridization (array CGH) data It implements a methodology for finding change-points in these data which are points after which the (log) test over reference ratios have changed location. This model is that the change-points correspond to positions where the underlying DNA copy number has changed. Therefore, change-points can be used to identify regions of gained and lost copy number. Also provided is a function for making relevant plots of these data.

Inne pakiety związane z r-bioc-dnacopy

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgfortran5 (>= 10)

  Runtime library for GNU Fortran applications

• dep: r-api-4.0

  pakiet wirtualny udostępniany przez r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18

  pakiet wirtualny udostępniany przez r-bioc-biocgenerics

Pobieranie r-bioc-dnacopy

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	370,8 KiB	518,0 KiB	[lista plików]
arm64	368,3 KiB	530,0 KiB	[lista plików]
armel	372,4 KiB	521,0 KiB	[lista plików]
armhf	367,4 KiB	493,0 KiB	[lista plików]
i386	371,1 KiB	509,0 KiB	[lista plików]
mips64el	369,9 KiB	531,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	373,2 KiB	530,0 KiB	[lista plików]
s390x	373,2 KiB	514,0 KiB	[lista plików]