[ buster ] [ bullseye ] [ trixie ] [ sid ]

Pakiet źródłowy: trinityrnaseq (2.6.6+dfsg-6)

Odnośniki dla trinityrnaseq

Zasoby systemu Debian:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [trinityrnaseq.github.io]

Z tego pakietu źródłowego zbudowano następujące pakiety binarne:

trinityrnaseq: RNA-Seq De novo Assembly
trinityrnaseq-examples: RNA-Seq De novo Assembly common example and testing files

Inne pakiety związane z trinityrnaseq

build-depends

build-depends-indep

adep: debhelper (>= 11~)

Programy pomocnicze do debian/rules
adep: jellyfish (>= 2.1.4)

count k-mers in DNA sequences
adep: libjung-free-java

Java Universal Network/Graph Framework
adep: javahelper

Helper scripts for packaging Java programs
adep: libgetopt-java

GNU getopt - Java port
adep: default-jdk

Standard Java or Java compatible Development Kit
adep: parafly

parallel command processing using OpenMP
adep: libjs-jquery

JavaScript library for dynamic web applications
adep: jaligner

Smith-Waterman algorithm with Gotoh's improvement
adep: libhts-dev

development files for the HTSlib
adep: bowtie2

ultrafast memory-efficient short read aligner
adep: salmon

wicked-fast transcript quantification from RNA-seq data
adep: zlib1g-dev

Biblioteka do kompresji danych - pliki deweloperskie

Download trinityrnaseq

Plik	Rozmiar (w KiB)	Suma kontrolna MD5
trinityrnaseq_2.6.6+dfsg-6.dsc	2,2 KiB	f5c516d28548277504ff47a2acba85b2
trinityrnaseq_2.6.6+dfsg.orig.tar.xz	227 682,9 KiB	fcd4c7f246b355da4284d7104e74dd54
trinityrnaseq_2.6.6+dfsg-6.debian.tar.xz	24,1 KiB	0261c2bd1492725907b2224ed8c866f7

Repozytorium kodu źródłowego Debiana (VCS: Git): https://salsa.debian.org/med-team/trinityrnaseq.git
Repozytorium kodu źródłowego Debiana (do przeglądania): https://salsa.debian.org/med-team/trinityrnaseq