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Paquet source : trinityrnaseq (2.6.6+dfsg-6)

Liens pour trinityrnaseq

Les paquets binaires suivants sont compilés à partir de ce paquet source :

trinityrnaseq: assemblage de novo de séquences d’Arn
trinityrnaseq-examples: assemblage de novo de séquences d’Arn – fichiers de test et d’exemple

adep: debhelper (>= 11~)

programmes assistants pour debian/rules
adep: jellyfish (>= 2.1.4)

count k-mers in DNA sequences
adep: libjung-free-java

Java Universal Network/Graph Framework
adep: javahelper

scripts d'aide pour l'empaquetage de programmes Java
adep: libgetopt-java

GNU getopt - Java port
adep: default-jdk

kit de développement Java standard ou compatible
adep: parafly

parallel command processing using OpenMP
adep: libjs-jquery

JavaScript library for dynamic web applications
adep: jaligner

algorithme de Smith-Waterman avec l'amélioration de Gotoh
adep: libhts-dev

development files for the HTSlib
adep: bowtie2

aligneur ultra-rapide de lectures courtes avec une faible empreinte mémoire
adep: salmon

wicked-fast transcript quantification from RNA-seq data
adep: zlib1g-dev

bibliothèque de compression — paquet de développement

Fichier	Taille (en ko)	Somme MD5
trinityrnaseq_2.6.6+dfsg-6.dsc	2,2 ko	f5c516d28548277504ff47a2acba85b2
trinityrnaseq_2.6.6+dfsg.orig.tar.xz	227 682,9 ko	fcd4c7f246b355da4284d7104e74dd54
trinityrnaseq_2.6.6+dfsg-6.debian.tar.xz	24,1 ko	0261c2bd1492725907b2224ed8c866f7

Dépôt Debian des paquets source (VCS: Git): https://salsa.debian.org/med-team/trinityrnaseq.git
Dépôt Debian des paquets source (interface web): https://salsa.debian.org/med-team/trinityrnaseq