Pakiet: kalign (1:3.4.0-1 i inne) [debports]

[ Pakiet źródłowy:  ]

Globalne i progresywne dopasowywanie wielu sekwencji

Kalign jest narzędziem wiersza poleceń do przeprowadzenia wielokrotnego dopasowywania sekwencji biologicznych. Wykorzystuje algorytm dopasowywania ciągów Mutha-Manbera do poprawiania zarówno dokładności, jak i szybkości wyrównywania. Program wykorzystuje globalne, progresywne podejście do dopasowywania, wzbogacone o zastosowanie przybliżonego algorytmu dopasowywania ciągów do obliczania odległości sekwencji oraz poprzez włączenie lokalnych dopasowań do globalnego wyrównywania.

Inne pakiety związane z kalign

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• enh: bioperl-run

  Nakładki na BioPerl: skrypty

• enh: t-coffee

  Wielosekwencyjne wyrównanie

Pobieranie kalign

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
x32 (port nieoficjalny)	1:3.4.0-1+b1	90,2 KiB	329,0 KiB	[lista plików]