Paket: kalign (1:3.4.0-1 und andere) [debports]
Links für kalign
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket herunterladen:
Nicht gefundenBetreuer:
Externe Ressourcen:
- Homepage [msa.sbc.su.se]
Ähnliche Pakete:
Globales und fortschreitendes multiples Sequenzalignment
Das Befehlszeilenwerkzeug Kalign gleicht mehrere biologische Sequenzen ab. Für die Erhöhung von Präzision und Geschwindigkeit nutzt es den Muth-Manber-Algorithmus, der in großen Datenmengen sich wiederholende Muster ermittelt. Das Programm verwendet einen globalen, fortschreitenden Alignment-Ansatz, ergänzt durch den Einsatz eines annähernden Musterabgleich-Algorithmus zur Berechnung von Sequenzabständen und durch die Einbeziehung lokaler Übereinstimmungen in ein ansonsten globales Alignment.
Andere Pakete mit Bezug zu kalign
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
-
- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)
-
- enh: bioperl-run
- BioPerl-Hüllen: Skripte
-
- enh: t-coffee
- Multiple Sequence Alignment
kalign herunterladen
Architektur | Version | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
---|---|---|---|---|
x32 (inoffizielle Portierung) | 1:3.4.0-1+b1 | 90,2 kB | 329,0 kB | [Liste der Dateien] |