Pakiet: svim (2.0.0-3)

[ Pakiet źródłowy: svim  ]

Structural variant caller for long sequencing reads

SVIM is a structural variant caller for long sequencing reads. It is able to detect, classify and genotype five different classes of structural variants. Unlike existing methods, SVIM integrates information from across the genome to precisely distinguish similar events, such as tandem and interspersed duplications and simple insertions.

Inne pakiety związane z svim

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

• dep: python3-cpuinfo

  Python module for getting CPU info (Python 3)

• dep: python3-edlib

  library for sequence alignment using edit distance (Python3 module)

• dep: python3-matplotlib

  System do rysowania wykresów oparty na Pythonie w stylu podobnym do Matlaba

• dep: python3-numpy

  Szybkie zarządzanie tablicami w języku Python (Python 3)

• dep: python3-pysam

  interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

• dep: python3-pyspoa

  Python bindings to spoa

• dep: python3-scipy

  Narzędzia naukowe dla Pythona 3

Pobieranie svim

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	33,6 KiB	259,0 KiB	[lista plików]