Pakiet: r-bioc-hdf5array (1.34.0-2 i inne)

[ Pakiet źródłowy: r-bioc-hdf5array  ]

HDF5 backend for DelayedArray objects

Implements the HDF5Array and TENxMatrix classes, 2 convenient and memory-efficient array-like containers for on-disk representation of HDF5 datasets. HDF5Array is for datasets that use the conventional (i.e. dense) HDF5 representation. TENxMatrix is for datasets that use the HDF5-based sparse matrix representation from 10x Genomics (e.g. the 1.3 Million Brain Cell Dataset). Both containers being DelayedArray extensions, they support all operations supported by DelayedArray objects. These operations can be either delayed or block-processed.

Inne pakiety związane z r-bioc-hdf5array

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libhdf5-103-1t64 [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  HDF5 C runtime files - serial version

• dep: libhdf5-310 (>= 1.14.4.3) [nie hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  HDF5 C runtime files - serial version

• dep: libhdf5-hl-100t64 [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  HDF5 High Level runtime files - serial version

• dep: libhdf5-hl-310 (>= 1.8.13) [nie hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  HDF5 High Level runtime files - serial version

• dep: r-api-4.0

  pakiet wirtualny udostępniany przez r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  Pakiet niedostępny

• dep: r-api-bioc-3.20 [nie hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  pakiet wirtualny udostępniany przez r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.31.5) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  generic functions for Bioconductor

  dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.51.2) [nie hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: r-bioc-delayedarray (>= 0.27.2) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  BioConductor delayed operations on array-like objects

  dep: r-bioc-delayedarray (>= 0.31.8) [nie hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: r-bioc-iranges

  GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

• dep: r-bioc-rhdf5 (>= 2.31.6)

  BioConductor HDF5 interface to R

• dep: r-bioc-rhdf5filters

  GNU R HDF5 compression filters

• dep: r-bioc-rhdf5lib

  GNU R hdf5 library

• dep: r-bioc-s4arrays (>= 1.1.1)

  foundation of array-like containers in Bioconductor

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.27.13)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-sparsearray (>= 1.5.42) [nie hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  efficient in-memory representation of multidimensional sparse arrays

• dep: r-cran-matrix

  GNU R package of classes for dense and sparse matrices

• sug: r-bioc-biocparallel [nie m68k]

  BioConductor facilities for parallel evaluation

• sug: r-bioc-delayedmatrixstats

  Functions on Rows and Columns of 'DelayedMatrix' Objects

• sug: r-bioc-experimenthub

  BioConductor client to access ExperimentHub resources

• sug: r-bioc-genefilter

  methods for filtering genes from microarray experiments

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations

• sug: r-bioc-genomicranges

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• sug: r-bioc-singlecellexperiment

  S4 Classes for Single Cell Data

• sug: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.15.1)

  BioConductor assay container

• sug: r-cran-runit

  GNU R package providing unit testing framework

Pobieranie r-bioc-hdf5array

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.34.0-2	8 582,1 KiB	9 125,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.34.0-2	8 582,4 KiB	9 085,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.34.0-2	8 577,3 KiB	9 125,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.30.1-1+b1	8 560,4 KiB	9 064,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.30.1-1+b1	8 564,6 KiB	9 158,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	1.34.0-2	8 578,9 KiB	9 124,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.30.1-1+b1	8 548,6 KiB	9 020,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.34.0-2	8 574,5 KiB	9 133,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.34.0-2	8 585,2 KiB	9 192,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.34.0-2	8 584,3 KiB	9 125,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.34.0-2	8 579,0 KiB	9 053,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.34.0-2	8 583,4 KiB	9 101,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.30.1-1+b1	8 565,0 KiB	9 024,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.34.0-2	8 571,3 KiB	9 961,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.30.1-1+b1	8 559,0 KiB	9 032,0 KiB	[lista plików]