パッケージ: r-bioc-hdf5array (1.34.0-2 など)

[ ソース: r-bioc-hdf5array  ]

HDF5 backend for DelayedArray objects

Implements the HDF5Array and TENxMatrix classes, 2 convenient and memory-efficient array-like containers for on-disk representation of HDF5 datasets. HDF5Array is for datasets that use the conventional (i.e. dense) HDF5 representation. TENxMatrix is for datasets that use the HDF5-based sparse matrix representation from 10x Genomics (e.g. the 1.3 Million Brain Cell Dataset). Both containers being DelayedArray extensions, they support all operations supported by DelayedArray objects. These operations can be either delayed or block-processed.

その他の r-bioc-hdf5array 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libhdf5-103-1t64 [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  HDF5 C runtime files - serial version

• dep: libhdf5-310 (>= 1.14.4.3) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32 以外]

  HDF5 C runtime files - serial version

• dep: libhdf5-hl-100t64 [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  HDF5 High Level runtime files - serial version

• dep: libhdf5-hl-310 (>= 1.8.13) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32 以外]

  HDF5 High Level runtime files - serial version

• dep: r-api-4.0

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  パッケージは利用できません

• dep: r-api-bioc-3.20 [hppa, ia64, m68k, sh4, x32 以外]

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.31.5) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  generic functions for Bioconductor

  dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.51.2) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32 以外]

• dep: r-bioc-delayedarray (>= 0.27.2) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

  BioConductor delayed operations on array-like objects

  dep: r-bioc-delayedarray (>= 0.31.8) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32 以外]

• dep: r-bioc-iranges

  GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

• dep: r-bioc-rhdf5 (>= 2.31.6)

  BioConductor HDF5 interface to R

• dep: r-bioc-rhdf5filters

  GNU R HDF5 compression filters

• dep: r-bioc-rhdf5lib

  GNU R hdf5 library

• dep: r-bioc-s4arrays (>= 1.1.1)

  foundation of array-like containers in Bioconductor

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.27.13)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-sparsearray (>= 1.5.42) [hppa, ia64, m68k, sh4, x32 以外]

  efficient in-memory representation of multidimensional sparse arrays

• dep: r-cran-matrix

  GNU R package of classes for dense and sparse matrices

• sug: r-bioc-biocparallel [m68k 以外]

  BioConductor facilities for parallel evaluation

• sug: r-bioc-delayedmatrixstats

  Functions on Rows and Columns of 'DelayedMatrix' Objects

• sug: r-bioc-experimenthub

  BioConductor client to access ExperimentHub resources

• sug: r-bioc-genefilter

  methods for filtering genes from microarray experiments

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations

• sug: r-bioc-genomicranges

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• sug: r-bioc-singlecellexperiment

  S4 Classes for Single Cell Data

• sug: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.15.1)

  BioConductor assay container

• sug: r-cran-runit

  GNU R package providing unit testing framework

r-bioc-hdf5array のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	1.34.0-2	8,582.1 kB	9,125.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.34.0-2	8,582.4 kB	9,085.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.34.0-2	8,577.3 kB	9,125.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	1.30.1-1+b1	8,560.4 kB	9,064.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	1.30.1-1+b1	8,564.6 kB	9,158.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	1.30.1-1+b1	8,548.6 kB	9,020.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.34.0-2	8,574.5 kB	9,133.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.34.0-2	8,585.2 kB	9,192.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.34.0-2	8,584.3 kB	9,125.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.34.0-2	8,579.0 kB	9,053.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.34.0-2	8,583.4 kB	9,101.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	1.30.1-1+b1	8,565.0 kB	9,024.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.34.0-2	8,571.3 kB	9,961.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	1.30.1-1+b1	8,559.0 kB	9,032.0 kB	[ファイル一覧]