Pakiet: phyx (1.3.2+ds-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: phyx  ]

UNIX-style phylogenetic analyses on trees and sequences

phyx provides a convenient, lightweight and inclusive toolkit consisting of programs spanning the wide breadth of programs utilized by researchers performing phylogenomic analyses. Modeled after Unix/GNU/Linux command line tools, individual programs perform a single task and operate on standard I/O streams. A result of this stream-centric approach is that, for most programs, only a single sequence or tree is in memory at any moment. Thus, large datasets can be processed with minimal memory requirements. phyx’s ever-growing complement of programs consists of over 35 programs focused on exploring, manipulating, analyzing and simulating phylogenetic objects (alignments, trees and MCMC logs). As with standard Unix command line tools, these programs can be piped (together with non-phyx tools), allowing the easy construction of efficient analytical pipelines.

Inne pakiety związane z phyx

• dep: libarmadillo14 (>= 1:14.0.1+dfsg)

  streamlined C++ linear algebra library

• dep: libc6 (>= 2.38) [nie alpha, loong64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 14.2.0-7) [loong64]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 4.0) [nie arm64, hppa, i386, loong64, m68k, mips64el, riscv64, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libnlopt0 (>= 2.6.1)

  nonlinear optimization library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie alpha]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 14.2.0-7) [alpha]

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

Pobieranie phyx

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.3.2+ds-1	2 187,4 KiB	23 983,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.3.2+ds-1	2 336,3 KiB	21 266,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.3.2+ds-1	2 094,8 KiB	21 002,0 KiB	[lista plików]
armel	1.3.2+ds-1	1 867,5 KiB	18 601,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.3.2+ds-1	1 812,7 KiB	13 269,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.3.1+ds-2+b2	1 950,7 KiB	18 593,0 KiB	[lista plików]
i386	1.3.2+ds-1	2 474,8 KiB	22 033,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	1.3.2+ds-1	2 139,1 KiB	21 178,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.3.2+ds-1	2 057,2 KiB	19 273,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.3.2+ds-1	2 189,1 KiB	26 265,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.3.2+ds-1	2 257,1 KiB	27 146,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.3.2+ds-1	2 176,6 KiB	25 226,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.3.2+ds-1	2 100,8 KiB	15 686,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.3.2+ds-1	2 145,4 KiB	21 846,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.3.2+ds-1	2 257,0 KiB	20 124,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.3.2+ds-1	2 130,7 KiB	52 823,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.3.2+ds-1	2 305,2 KiB	20 005,0 KiB	[lista plików]