wszystkie opcje
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: bio-vcf  ]

Pakiet: bio-vcf (0.9.5-3)

Odnośniki dla bio-vcf

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego bio-vcf:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

domain specific language (DSL) for processing the VCF format

Bio-vcf provides a domain specific language (DSL) for processing the VCF format. Record named fields can be queried with regular expressions, e.g.

 sample.dp>20 and rec.filter !~ /LowQD/ and rec.tumor.bcount[rec.alt]>4

Bio-vcf is a new generation VCF parser, filter and converter. Bio-vcf is not only very fast for genome-wide (WGS) data, it also comes with a really nice filtering, evaluation and rewrite language and it can output any type of textual data, including VCF header and contents in RDF and JSON.

Inne pakiety związane z bio-vcf

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie bio-vcf

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
all 28,1 KiB141,0 KiB [lista plików]