Pakiet: phybin (0.3-6)

[ Pakiet źródłowy: phybin  ]

binning/clustering newick trees by topology

PhyBin is a simple command line tool that classifies a set of Newick tree files by their topology. The purpose of it is to take a large set of tree files and browse through the most common tree topologies.

It can do simple binning of identical trees or more complex clustering based on an all-to-all Robinson-Foulds distance matrix.

phybin produces output files that characterize the size and contents of each bin or cluster (including generating GraphViz-based visual representations of the tree topologies).

Inne pakiety związane z phybin

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libffi8 (>= 3.4)

  Pliki biblioteki uruchomieniowej dla interfejsu funkcji obcych

• dep: libgmp10 (>= 2:6.2.1+dfsg1)

  Biblioteka działań arytmetycznych z dużą dokładnością

Pobieranie phybin

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
i386	4 957,4 KiB	37 630,0 KiB	[lista plików]