Pakiet: python3-pyranges (0.0.111+ds-8)

[ Pakiet źródłowy: pyranges  ]

2D representation of genomic intervals and their annotations

A PyRanges object must have the columns Chromosome, Start and End. These describe the genomic position and function as implicit row labels. A Strand column is optional and adds strand information to the intervals. Any other columns are allowed and are considered metadata.

The structure can be filled from .bed, .bam or .gff files, also from tabular or textual representations.

Inne pakiety związane z python3-pyranges

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

• dep: python3-natsort

  Natural sorting for Python (Python3)

• dep: python3-ncls

  datastructure for interval overlap queries

• dep: python3-pandas

  data structures for "relational" or "labeled" data

• dep: python3-pyrle

  run length arithmetic in Python

• dep: python3-sorted-nearest

  Cython helper library for pyranges

• dep: python3-tabulate

  pretty-print tabular data in Python3

• sug: python-pyranges-doc

  Pakiet niedostępny

Pobieranie python3-pyranges

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	428,0 KiB	1 490,0 KiB	[lista plików]