Pakiet: pbalign (0.3.2-1)

[ Pakiet źródłowy: pbalign  ]

map Pacific Biosciences reads to reference DNA sequences

pbalign aligns PacBio reads to reference sequences, filters aligned reads according to user-specific filtering criteria, and converts the output to either the SAM format or PacBio Compare HDF5 (e.g., .cmp.h5) format.

This package is part of the SMRTAnalysis suite.

Inne pakiety związane z pbalign

• dep: blasr (>= 5.3+0)

  mapping single-molecule sequencing reads

• dep: python

  Interaktywny, wysokopoziomowy język obiektowy (wersja Python2)

• dep: python-pbalign (= 0.3.2-1)

  map Pacific Biosciences reads to reference DNA sequences (Python2)

• dep: python-pkg-resources

  Wykrywanie pakietów i udostępnianie zasobów przy użyciu pkg_resources

• rec: hdf5-tools

  Hierarchiczny Format Danych (HDF5) - narzędzia uruchomieniowe

• rec: python-pbh5tools

  tools for manipulating Pacific Biosciences HDF5 files -- Python 2 library

• sug: bowtie2

  ultrafast memory-efficient short read aligner

• sug: gmap

  Dopasowanie splicingowe i tolerancyjne SNP dla mRNA i krótkich odczytów

• sug: pbalign-doc

  documentation for pbalign

Pobieranie pbalign

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	9,3 KiB	44,0 KiB	[lista plików]