Pakiet: mummer (3.23+dfsg-7)
Odnośniki dla mummer
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego mummer:
Opiekunowie:
- Debian Med Packaging Team (Strona QA, Archiwum e-mail)
- Steffen Moeller (Strona QA)
- Andreas Tille (Strona QA)
- Charles Plessy (Strona QA)
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [mummer.sourceforge.net]
Podobne pakiety:
Efficient sequence alignment of full genomes
MUMmer is a system for rapidly aligning entire genomes, whether in complete or draft form. For example, MUMmer 3.0 can find all 20-basepair or longer exact matches between a pair of 5-megabase genomes in 13.7 seconds, using 78 MB of memory, on a 2.4 GHz Linux desktop computer. MUMmer can also align incomplete genomes; it handles the 100s or 1000s of contigs from a shotgun sequencing project with ease, and will align them to another set of contigs or a genome using the NUCmer program included with the system. If the species are too divergent for DNA sequence alignment to detect similarity, then the PROmer program can generate alignments based upon the six-frame translations of both input sequences.
Inne pakiety związane z mummer
|
|
|
|
-
- dep: gawk
- GNU awk, język wyszukiwania i obróbki wzorców tekstu
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- Biblioteka wspomagająca GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
-
- dep: perl
- praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla
Pobieranie mummer
Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
---|---|---|---|
arm64 | 625,1 KiB | 3 153,0 KiB | [lista plików] |