Pakiet: r-cran-spp (1.16.0-2)

[ Pakiet źródłowy: r-cran-spp  ]

GNU R ChIP-seq processing pipeline

R package for anlaysis of ChIP-seq and other functional sequencing data

 * Assess overall DNA-binding signals in the data and select appropriate
   quality of tag alignment.
 * Discard or restrict positions with abnormally high number of tags.
 * Calculate genome-wide profiles of smoothed tag density and save them
   in WIG files for viewing in other browsers.
 * Calculate genome-wide profiles providing conservative statistical
   estimates of fold enrichment ratios along the genome. These can be
   exported for browser viewing, or thresholded to determine regions of
   significant enrichment/depletion.
 * Determine statistically significant point binding positions
 * Assess whether the set of point binding positions detected at a
   current sequencing depth meets saturation criteria, and if does not,
   estimate what sequencing depth would be required to do so.

Inne pakiety związane z r-cran-spp

• dep: libbz2-1.0

  Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: r-api-4.0

  pakiet wirtualny udostępniany przez r-base-core

• dep: r-base-core (>= 4.0.2-1)

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-bioc-rsamtools

  GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import

• dep: r-cran-bh (>= 1.66)

  (Virtual) GNU R package to provide BH

• dep: r-cran-catools

  GNU R package providing various utility functions

• dep: r-cran-rcpp

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie r-cran-spp

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	315,3 KiB	453,0 KiB	[lista plików]
arm64	309,7 KiB	425,0 KiB	[lista plików]
armel	309,8 KiB	424,0 KiB	[lista plików]
armhf	309,5 KiB	391,0 KiB	[lista plików]
i386	320,8 KiB	459,0 KiB	[lista plików]
mips64el	308,7 KiB	452,0 KiB	[lista plików]
mipsel	308,6 KiB	454,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	317,2 KiB	497,0 KiB	[lista plików]
s390x	311,0 KiB	444,0 KiB	[lista plików]