Pakiet: pscan-tfbs (1.2.2-4 i inne)

[ Pakiet źródłowy: pscan-tfbs  ]

search for transcription factor binding sites

Pscan finds Over-represented Transcription Factor Binding Site Motifs in Sequences from Co-Regulated or Co-Expressed Genes.

Pscan is a software tool that scans a set of sequences (e.g. promoters) from co-regulated or co-expressed genes with motifs describing the binding specificity of known transcription factors and assesses which motifs are significantly over- or under-represented, providing thus hints on which transcription factors could be common regulators of the genes studied, together with the location of their candidate binding sites in the sequences. Pscan does not resort to comparisons with orthologous sequences and experimental results show that it compares favorably to other tools for the same task in terms of false positive predictions and computation time. The website is free and open to all users and there is no login requirement.

Inne pakiety związane z pscan-tfbs

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [nie armel, armhf]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

Pobieranie pscan-tfbs

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	1.2.2-4+b2	69,9 KiB	185,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.2.2-4+b2	62,3 KiB	165,0 KiB	[lista plików]
armel	1.2.2-4+b2	59,4 KiB	164,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.2.2-4+b2	59,1 KiB	164,0 KiB	[lista plików]
i386	1.2.2-4+b2	75,4 KiB	200,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.2.2-4+b2	66,2 KiB	235,0 KiB	[lista plików]
mipsel	1.2.2-4+b2	66,9 KiB	233,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.2.2-4+b2	72,7 KiB	293,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.2.2-4+b2	63,7 KiB	185,0 KiB	[lista plików]