Pakiet: mcaller (1.0.3+git20210624.b415090-3)

[ Pakiet źródłowy: mcaller  ]

Znajdowanie metylacji w odczytach nanoporów

    H
    |
  H-C-aller
    |
    H

Ten program przeznaczony jest do wyznaczania m6A na podstawie danych z nanoporów, wykorzystując różnice pomiędzy zmierzonymi i oczekiwanymi prądami.

Inne pakiety związane z mcaller

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-biopython

  Python3 library for bioinformatics

• dep: python3-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5

• dep: python3-matplotlib

  Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python 3 language

• dep: python3-pandas

  data structures for "relational" or "labeled" data

• dep: python3-pysam

  interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

• dep: python3-scipy

  Narzędzia naukowe dla Pythona 3

• dep: python3-seaborn

  statistical visualization library for Python3

• dep: python3-sklearn

  Python modules for machine learning and data mining - Python 3

• rec: nanopolish

  consensus caller for nanopore sequencing data

  lub poretools

  toolkit for nanopore nucleotide sequencing data

• sug: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner

• sug: graphmap

  Pakiet niedostępny

Pobieranie mcaller

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	18,5 KiB	83,0 KiB	[lista plików]