Pakiet: r-bioc-htsfilter (1.38.0+dfsg-2)

[ Pakiet źródłowy: r-bioc-htsfilter  ]

GNU R filter replicated high-throughput transcriptome sequencing data

This package implements a filtering procedure for replicated transcriptome sequencing data based on a global Jaccard similarity index in order to identify genes with low, constant levels of expression across one or more experimental conditions.

Inne pakiety związane z r-bioc-htsfilter

• dep: r-api-4.0

  pakiet wirtualny udostępniany przez r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16

  pakiet wirtualny udostępniany przez r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1)

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-bioc-biobase

  base functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocparallel

  BioConductor facilities for parallel evaluation

• dep: r-bioc-deseq2

  R package for RNA-Seq Differential Expression Analysis

• dep: r-bioc-edger

  Empirical analysis of digital gene expression data in R

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-edaseq

  GNU R exploratory data analysis and normalization for RNA-Seq

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

Pobieranie r-bioc-htsfilter

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	158,5 KiB	235,0 KiB	[lista plików]