Paquet : r-bioc-htsfilter (1.38.0+dfsg-2)

[ Paquet source : r-bioc-htsfilter  ]

GNU R filter replicated high-throughput transcriptome sequencing data

This package implements a filtering procedure for replicated transcriptome sequencing data based on a global Jaccard similarity index in order to identify genes with low, constant levels of expression across one or more experimental conditions.

Autres paquets associés à r-bioc-htsfilter

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  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16

  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1)

  noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques

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  fonctions de base pour Bioconductor

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  BioConductor facilities for parallel evaluation

• dep: r-bioc-deseq2

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• dep: r-bioc-edger

  analyse empirique de données numériques d’expressions de gène avec R

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-edaseq

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• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-testthat

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