Pakiet: ragout (2.3-4)
Odnośniki dla ragout
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego ragout:
Opiekunowie:
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [github.com]
Podobne pakiety:
Reference-Assisted Genome Ordering UTility
Ragout (Reference-Assisted Genome Ordering UTility) is a tool for chromosome-level scaffolding using multiple references. Given initial assembly fragments (contigs/scaffolds) and one or multiple related references (complete or draft), it produces a chromosome-scale assembly (as a set of scaffolds).
The approach is based on the analysis of genome rearrangements (like inversions or chromosomal translocations) between the input genomes and reconstructing the most parsimonious structure of the target genome.
Ragout now supports both small and large genomes (of mammalian scale and complexity). The assembly of highly polymorphic genomes is currently limited.
Inne pakiety związane z ragout
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2)
- Biblioteka wspomagająca GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: python3-networkx
- tool to create, manipulate and study complex networks (Python3)
-
- rec: sibelia
- comparative genomics tool
Pobieranie ragout
Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
---|---|---|---|
i386 | 2 089,6 KiB | 9 701,0 KiB | [lista plików] |