Pakiet: theseus (3.3.0-14)

[ Pakiet źródłowy: theseus  ]

superimpose macromolecules using maximum likelihood

Theseus is a program that simultaneously superimposes multiple macromolecular structures. Theseus finds the optimal solution to the superposition problem using the method of maximum likelihood. By down-weighting variable regions of the superposition and by correcting for correlations among atoms, the ML superposition method produces very accurate structural alignments.

When macromolecules with different residue sequences are superimposed, other programs and algorithms discard residues that are aligned with gaps. Theseus, however, uses a novel superimposition algorithm that includes all of the data.

Znaczniki: Biologia: Białka, Dziedzina: Biologia, field::biology:bioinformatics, field::biology:structural, Zaimplementowane w: C, Interfejs użytkownika: interface::commandline, role::program, Przeznaczenie: Analizowanie, use::comparing, works-with-format::plaintext

Inne pakiety związane z theseus

• dep: clustalo

  General-purpose multiple sequence alignment program for proteins

• dep: libc6 (>= 2.35)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: muscle

  Multiple alignment program of protein sequences

• sug: clustalw

  global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

• sug: dialign

  Dopasowanie wielu sekwencji w oparciu o segmenty

• sug: kalign

  Globalne i progresywne dopasowywanie wielu sekwencji

• sug: mafft

  Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

• sug: probcons

  PROBabilistic CONSistency-based multiple sequence alignment

• sug: t-coffee

  Wielosekwencyjne wyrównanie

• sug: theseus-examples

  superimpose macromolecules using maximum likelihood (examples)

Pobieranie theseus

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	374,1 KiB	964,0 KiB	[lista plików]